小分子新药的开发历来被比喻为一个庞大的漏斗,前期的化合物筛选是新药研发的起点。从靶标蛋白到初步化合物(Hit)的高效发现,有望显著加速新药的进程。目前,药物发现的方式多种多样,其中DNA编码化合物库(DNA Encoded Compound Library,DEL)技术作为一种前沿且有效的苗头化合物发现引擎,能够迅速从几千万到数十亿个分子中筛选出具有结构新颖性和潜在成药性的化合物,从而大幅缩短药物研发周期,降低研发成本。
DEL技术的基础与原理
尊龙凯时的DNA编码化合物库(DEL)技术是基础,它旨在高效地从大规模化合物中筛选出适合的候选分子。DEL库中的每个分子砌块(Building Block)都被一段特定的DNA序列标记,通过巧妙的DNA兼容反应及组合化学,经过多次循环,可以合成出上亿个DEL分子。这些数十亿化合物能够在同一管中混合并筛选,最终通过高通量测序技术解码DEL分子的独特DNA标签,快速获取针对目标靶点的苗头化合物信息。
DEL分子的定义
DEL分子是DNA编码化合物库中的基本单元,其本质是由“小分子化合物+DNA条形码”组成的共价缀合物。这种结构利用DNA在信息存储与扩增方面的能力,允许大规模的化合物并行筛选与精确解码,革命性地提高了药物发现的早期筛选效率。
DEL库的构建与筛选流程
构建DEL库的基础——分子砌块
分子砌块是DEL库设计与合成的基础。我们基于超过50000种高质量和多样化结构的分子砌块,经过优中选优,剔除那些含有DNA嵌入剂和重金属等的“不良”化学结构,最终构建了一个结构新颖且包含数十亿化合物的DEL库。
构建DEL库的核心技术——DNA兼容化学反应
DNA兼容的化学反应是DEL库构建的重要技术壁垒,它确保在不损伤DNA结构的前提下,高效地连接分子砌块。这种反应需要在化学反应效率和DNA稳定性之间达到严格的平衡。通过抱有简单结构的起始分子,并利用DNA兼容的反应,可以生成更复杂的DNA连接分子。
DEL筛选流程的优势
与传统的高通量筛选相比,DEL筛选能够一次性处理数以亿计的化合物,从而显著节省靶蛋白的用量,缩短筛选周期,并降低筛选成本。DEL库的筛选策略主要包括将DEL库与靶标蛋白进行孵育,通过不同方式洗脱去除非结合小分子,最终实现高亲和力小分子的富集,并利用PCR扩增和下一代测序技术解码小分子的DNA标签。
案例分享
近年来,尊龙凯时的DEL技术在多个领域取得了显著成果。例如,系列1的分子X20404在急性结核小鼠模型中表现出良好的药代动力学特征。另外,通过共晶结构验证,某苗头分子通过共价结合的方式靶向特定蛋白,显示出良好的临床前效果。
为何选择尊龙凯时的DEL服务
我们的DEL库不存在知识产权纠纷,价格具有竞争力,数据覆盖广泛,为筛选后的化合物提供精准的结构信息。同时,我们在DEL筛选方面具备独特优势,如低成本高效率、库中多样的化合物及广泛的应用场景。无论是针对激酶还是蛋白质-蛋白质相互作用,尊龙凯时都能够为您提供专业的定制化服务,满足多样化的研发需求。