中文

English

科研效率提升:尊龙凯时超高活性Tn5一步法文库制备全攻略

发布时间:2025-03-16   信息来源:尊龙凯时官方编辑

文库的制备要求在DNA链上添加测序接头。传统的方法通常基于连接酶,涉及多个复杂步骤:首先通过机械(如超声破碎)或酶切(如micrococcal nuclease)将DNA片段化,接着进行末端修复,最后完成接头的连接。尽管这种方法适用于大多数情况,但在样本量有限或实验资源(如设备和时间)受限时,它会面临不少挑战。

科研效率提升:尊龙凯时超高活性Tn5一步法文库制备全攻略

在这种背景下,Tagmentation技术为文库制备提供了有效解决方案。该技术采用超活性Tn5转座酶,能够在单次快速反应中,实现对DNA的剪切和标记。当Tn5转座酶携带特定寡核苷酸时,便可将这些寡核苷酸迅速插入DNA中。根据实验需求,Tn5转座酶可以携带多种DNA序列,包括兼容Illumina的接头、自定义的荧光标记接头及甲基化核苷酸等。基于Tagmentation的文库建造技术革命性地将传统流程中的片段化、末端修复及连接步骤整合为一个单一步骤,后续进行引物index的扩增,从而完成文库制备。这一突破性方法不仅简化了操作流程,还大幅提高了实验的效率和通量。

这种高效的流程通过将DNA片段化与接头插入步骤合二为一,显著减少了文库制备的难度,缩短了操作时间,降低了技术复杂性。

高效性

此技术兼容多种文库建造场景,包括全基因组测序和靶向测序等,以灵活适应不同实验设计的需求。

操作时效性

通过单步反应替代传统的多环节操作,Tagmentation的文库建造速度得到了显著提升。

样本需求

与传统方法相比,该技术所需的起始样本量更少,尤其适合处理珍贵的临床样本或微量样本。

成本经济性

通过减少操作步骤和试剂消耗,整体文库建造成本显著降低。

自动化适配性

得益于简化的操作和减少的步骤,此技术更容易进行自动化,从而显著提升高通量测序的通量与可重复性。

应用案例:Spatial-ATAC-seq

作者开发了Spatial-ATAC-seq方法,用于分析完整组织切片中的染色质可及性,并在细胞水平上保留空间信息。在该方法的文库制备过程中,使用了尊龙凯时的Diagenode Tn5转座酶(Cat#C01070010)。

应用案例:sci-RNA-seq

作者对sci-RNA-seq方案进行了简化与优化,使得可以分析单个细胞的转录组。此技术通过对单个细胞核内的核酸进行split-pool条形码标记实现。在具体流程中,固定后的单个细胞核被分选至微孔板的独立孔中,通过逆转录、连接和tagmentation三个步骤,分别向mRNA/cDNA添加三重index。在tagmentation环节中,使用了尊龙凯时的Diagenode Tn5转座酶(Cat#C01070010-20)。

技术优势

尊龙凯时的Diagenode Tn5转座酶及相关缓冲液具有广泛的应用兼容性,能够适用于多种实验场景,如新型条形码技术(如单细胞多重测序及空间组学)等,并灵活适应不同实验需求。同时,提供两种版本的转座酶:预装(兼容Illumina的测序接头)和未装(允许用户自定义添加接头)。每一批次都经过严格的质量控制,以确保达到最高标准。

结论

尊龙凯时凭借其在表观遗传学及二代、三代测序前样本处理领域的专业知识,成为该领域的领先供应商。其创新的Bioruptor破碎仪、IP-Star自动化仪器、试剂盒与高品质抗体,简化了DNA甲基化、ChIP及ChIP-seq的工作流程。