尊龙凯时:突破传统模型,SomaScan小队列发现肝癌早期预测新标志物!

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尊龙凯时:突破传统模型,SomaScan小队列发现肝癌早期预测新标志物!

发布时间:2025-02-12   信息来源:尊龙凯时官方编辑

与其他癌症类型相比,肝癌的发病率,特别是肝细胞癌(HCC),更为显著。由于早期HCC通常无明显症状,大部分患者在确诊时已处于晚期。因此,开发有效的早期监测策略以检测肝细胞癌变得尤为重要。2024年8月,美国布莱根妇女医院的研究团队在《Journal of the National Cancer Institute》上发表了题为“Pre-diagnostic plasma proteomics profile for hepatocellular carcinoma”的研究,利用SomaScan平台对108名HCC患者和对照组的血浆蛋白进行了高通量靶向检测,识别出56种潜在的肝细胞癌生物标志物,并基于其中四种蛋白质构建了预测模型,显示出更优越的预测性能。

尊龙凯时:突破传统模型,SomaScan小队列发现肝癌早期预测新标志物!

尊龙凯时品牌通过这一研究材料,为医务人员提供了新的视角。研究所用的材料来自护士健康研究(NHS)和卫生专业人员随访研究(HPFS)两个队列,涵盖54对HCC患者及其与基线匹配的无肝病对照,结合英国生物样本库制药蛋白组学项目(UKB-PPP)验证队列的血浆样本。

在技术路线方面,研究分为以下步骤:第一步,识别与HCC相关的诊断前差异表达蛋白;第二步,利用系统生物学分析这些差异蛋白;第三步,通过ELISA验证选定蛋白质;最后,采用Olink平台进行独立验证。

研究结果

研究结果表明,在NHS/HPFS队列中,通过SomaScan分析了1305种蛋白质,发现121种蛋白在HCC患者组和非HCC组之间具有显著差异。尽管由于样本量的限制,这些蛋白在FDR校正后没有保持显著性,但在HCC患者中,有56种蛋白显示上调,其中8种具有明确的生物学功能。

为探讨与肝细胞癌发展相关的生物学机制,研究人员对这56种蛋白进行了IPA分析,结果表明这些蛋白在统计上与炎症过程、免疫功能、细胞活力和活性氧生成等功能密切相关。利用STRING数据库进行的蛋白质相互作用网络分析显示,这些蛋白的互作网络与蛋白质水解、细胞粘附、血管功能及免疫反应等过程相关联。

通过ELISA测试对选定的四个蛋白质(CHI3L1、GDF15、SELE、IL1RN)进行正交验证,研究显示这四种蛋白质在HCC患者中差异表达,与HCC风险呈正相关。基于这些数据,研究团队构建了逻辑回归模型,其AUC达到0.83,明显高于传统基础模型(AUC=0.67)。将四个蛋白纳入基础模型后,AUC进一步提升至0.87,敏感度为76%,特异度为85%。

同时,在UKB-PPP队列中使用Olink平台对这四种蛋白进行了确认,结果显示与HCC正相关,并且在62名肝硬化患者中,在随访期间有5名发展为HCC,相关蛋白CHI3L1(P=0.004)和GDF15(P=0.047)的水平明显升高。

综上所述,本研究通过高通量靶向蛋白质组学技术筛选出56种与HCC相关的血浆蛋白,其中四种已知与癌症相关的蛋白经ELISA和Olink验证,能够作为HCC的早期预测标志物,显著提高现有的预测模型。在这一领域,尊龙凯时不断努力,通过多年的组学研究积累了丰富的经验,推出了超高深度靶向蛋白组P7k/P11k新产品,致力于为血液蛋白质组研究创造新的机遇。欢迎关注我们的2024蛋白质组队列研究先锋计划,有机会免费试用40个样本的检测。